Merkzettel für seltsames Verhalten des Tomcat:

Enthält eine WebApp eine Datei META-INF/context.xml so wird beim Deployment eine Datei $TOMCAT_HOME/conf/Catalina/$HOSTNAME/$APPNAME.xml angelegt. Soweit so gut.

Leider funktioniert danach ein deployOnStartup nicht mehr. Will heissen, wenn der Tomcat beendet wird, $TOMCAT_HOME/webapps/$APP gelöscht wird und $TOMCAT_HOME/webapps/$APP.war aktualisiert wird und danach der Tomcat gestartet wird bleibt die war-Datei liegen, wird nicht angefasst und ist demzufolge auch nicht verfügbar.

Es hilft lediglich, das Verzeichnis $TOMCAT_HOME/conf/Catalina/$HOSTNAME for dem Neustart des Tomcat zu löschen.